航空
游览禾木-喀纳斯景区一般先到布尔津县城，可从乌鲁木齐乘飞机到阿勒泰，飞机飞行1小时，抵达阿勒泰后在团结路16号的长途汽车站乘车去布尔津要1.5小时，再从布尔津乘2小时车抵达喀纳斯。距阿勒泰市西北123公里的喀纳斯图瓦新村直升机场工程已完工并通过验收，游客可乘直升飞机直达喀纳斯。此外，游客可从乌鲁木齐直接飞往喀纳斯机场，空中时间仅需要1小时。喀纳斯机场位于黑流滩，距离喀纳斯湖50公里，下机后再乘车1小时即可到达喀纳斯景区。
公路
从乌鲁木齐直接乘卧铺汽车到布尔津（乌鲁木齐碾子沟车站发车，每天11：00和17：30各一班，票价110元）。从布尔津租车前往贾登峪，喀纳斯距贾登峪约30公里，有旅游车进入喀纳斯；禾木距贾登峪约35公里，不通公路，需要骑马或徒步进入，租马的价格约为100元/天，马夫兼向导50元/天。如果体力允许，建议选择走贾登峪-禾木-喀纳斯湖的徒步线路，约需4-5天时间，整个喀纳斯国家级自然保护区最美丽的风景可以一览无余。
市内交通
包车
禾木-喀纳斯景区的包车费用大致如下：布尔津到贾登峪200元/车，贾登峪到禾木村200元/车，禾木村到布尔津400元/车。尽管前往景区的游人很多，但是到了当地想找到人拼车并不容易，甚至有些地方还没有手机信号，联络起来十分不便，建议在到达景区之前组好固定的4人团队。
区间车
1路景区区间路线贾登峪换乘中心――驼颈湾――花楸谷――喀纳斯河大桥――卧龙湾――月亮湾――喀纳斯村换乘中心（神仙湾）
2路景区区间路线喀纳斯村换乘中心（神仙湾）――鸭泽湖――风情园――平台――丁字路口――乡政府――环湖――边防派出所――观鱼亭售票处――地区培训中心（原科普园）――新村――观鱼亭